Skip to main content

Table 2 Mutant SEZ6 assay by digital droplet PCR in healthy control subjects, patients with sporadic Alzheimer’s disease, and family members

From: Exome sequencing in an Italian family with Alzheimer’s disease points to a role for seizure-related gene 6 (SEZ6) rare variant R615H

Healthy population (n = 191)

Sporadic AD cases (n = 9)

Family members (n = 3)

Sample

Target

Concentration

(copies/μl)

Target

Concentration

(copies/μl)

Sample

Target

Concentration (copies/μl)

Target

Concentration (copies/μl)

Sample

Target

Concentration

(copies/μl)

Target

Concentration (copies/μl)

RATIO (mut/wt)

6

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

17

PR3

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

239

PR1

MUT SEZ6

116

WT SEZ6

103

1.13

7

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

14

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

226

MUT SEZ6

114

WT SEZ6

120

0.95

8

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

11

PR4

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

220

PR2

MUT SEZ6

130

WT SEZ6

130

1.00

9

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

59

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

224

MUT SEZ6

131

WT SEZ6

127

1.03

11

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

41

PR6

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

267

PR5

MUT SEZ6

149

WT SEZ6

153

0.97

12

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

49

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

261

MUT SEZ6

154

WT SEZ6

152

1.01

13

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

36

PR7

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

331

      

14

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

29

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

371

      

16

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

29

PR8

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

307

      

17

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

27

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

303

      

18

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

43

PR9

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

254

      

19

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

30

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

266

      

21

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

35

PR10

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

239

      

22

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

53

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

273

      

23

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

37

PR11

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

233

      

24

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

45

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

228

      

25

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

32

PR12

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

212

      

27

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

26

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

190

      

28

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

47

           

29

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

48

           

30

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

30

           

34

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

30

           

36

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

49

           

38

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

32

           

39

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

34

           

41

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

74

           

42

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

43

           

44

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

53

           

46

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

64

           

51

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

55

           

52

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

19

           

53

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

32

           

60

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

46

           

61

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

44

           

62

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

64

           

64

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

55

           

66

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

45

           

67

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

46

           

69

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

48

           

70

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

45

           

71

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

67

           

72

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

57

           

74

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

54

           

89

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

47

           

90

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

78

           

91

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

64.3

           

101

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

283

           

112

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

524

           

113

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1451

           

114

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

962

           

115

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

534

           

118

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

527

           

119

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1691

           

120

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

359

           

129

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

186

           

130

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

258

           

133

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

232

           

135

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

373

           

137

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

319

           

144

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

310

           

151

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

396

           

152

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

180

           

160

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

574

           

162

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

400

           

163

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

142

           

164

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

39

           

170

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

96

           

179

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

94

           

180

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

27

           

182

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1406

           

184

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1994

           

185

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

161

           

192

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

14.5

           

193

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1740

           

197

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

185

           

198

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

250

           

199

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

145

           

200

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

132

           

202

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

663

           

205

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

658

           

206

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

118

           

210

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

103

           

212

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

23

           

214

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

385

           

215

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

125

           

219

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

223

           

223

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

316

           

228

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

109

           

233

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

385

           

237

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

767

           

240

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

318

           

241

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

15

           

243

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

30

           

245

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

166

           

247

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

161

           

251

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

164

           

253

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

491

           

254

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

772

           

255

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

771

           

257

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

148

           

261

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

875

           

263

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

381

           

267

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

442

           

270

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

368

           

275

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

317

           

276

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

368

           

277

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

186

           

278

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

63

           

279

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

234

           

287

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

99

           

293

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

125

           

324

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

605

           

325

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

153

           

326

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

692

           

327

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

713

           

328

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

391

           

332

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

759

           

333

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

661

           

337

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

798

           

338

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

903

           

340

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

40

           

341

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

274

           

342

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

240

           

344

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

209

           

345

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

873

           

348

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

2330

           

350

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

387

           

351

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

430

           

353

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

360

           

360

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

473

           

361

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

553

           

362

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

2470

           

363

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

889

           

366

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1990

           

367

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

452

           

368

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1736

           

369

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1436

           

375

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

588

           

376

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

544

           

377

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

623

           

401

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

803

           

404

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

494

           

406

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

200

           

407

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

482

           

408

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

105

           

409

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

3260

           

418

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

190

           

422

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1325

           

430

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

772

           

434

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1233

           

435

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1844

           

440

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

90

           

446

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

745

           

451

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1366

           

453

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1185

           

454

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

2950

           

466

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

329

           

468

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

681

           

493

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

80

           

497

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

154

           

499

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

128

           

501

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1814

           

511

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

547

           

512

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

48.2

           

513

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

40.8

           

514

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1019

           

519

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1382

           

520

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

791

           

521

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1858

           

522

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

2180

           

523

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1849

           

531

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

2110

           

532

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

3030

           

535

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1096

           

537

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1941

           

538

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

78

           

539

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

917

           

542

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1650

           

543

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

937

           

545

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1423

           

546

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

818

           

549

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1196

           

550

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

716

           

558

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

845

           

567

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

724

           

570

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

765

           

571

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

2290

           

574

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

790

           

575

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1399

           

578

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

1293

           

580

MUT SEZ6

N.D.

WT SEZ6

947

           
  1. ND Not detectable
  2. Alzheimer’s disease cases are underlined. For each group, patient code, digital droplet PCR target, and the calculated concentration (copies/μl) are reported. For the last group, the ratio, defined as concentration mutant SEZ6/concentration wild-type SEZ6, is also reported