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Table 3 Tracts for which apolipoprotein E status showed a significant effect on diffusion metrics

From: White matter microstructure is altered in cognitively normal middle-aged APOE-ε4 homozygotes

 

MD

AxD

RD

FA

 

Recessive

Additive

Dom.

Recessive

Additive

Dom.

Recessive

Additive

Dom.

 

Name of tract

t

p

size

t

p

size

 

t

p

size

t

p

size

 

t

p

size

t

p

size

  

Anterior thalamic radiation L

2,57

0,02

11,45

n.s.

n.s.

n.s.

n.s.

n.s.

2,74

0,02

21,78

2,94

0,02

30,47

n.s.

n.s.

Anterior thalamic radiation R

3,11

0,02

7,08

3,25

0,05

0,33

n.s.

n.s.

3,50

0,02

13,02

3,26

0,03

11,89

Corticospinal tract L

3,15

0,02

43,29

2,70

0,05

2,92

3,44

0,04

7,28

n.s.

3,98

0,02

48,84

3,48

0,03

32,33

Corticospinal tract R

3,09

0,01

52,32

3,00

0,05

12,68

3,05

0,02

37,65

2,87

0,05

7,81

3,11

0,02

36,13

2,91

0,03

15,57

Forceps major

3,82

0,01

38,51

3,69

0,04

8,59

4,52

0,02

14,39

n.s.

3,69

0,01

39,94

3,50

0,02

37,25

Forceps minor

3,88

0,03

5,58

n.s.

n.s.

n.s.

3,56

0,04

40,51

3,06

0,04

38,88

Inferior fronto-occipital fasciculus L

4,17

0,01

58,59

n.s.

n.s.

n.s.

4,37

0,01

70,08

4,47

0,02

70,04

Inferior fronto-occipital fasciculus R

4,59

0,01

40,72

4,39

0,04

11,94

3,43

0,02

9,50

n.s.

3,83

0,01

56,33

3,60

0,03

50,39

Inferior longitudinal fasciculus L

4,57

0,01

72,19

n.s.

n.s.

n.s.

4,41

0,01

82,47

3,95

0,02

78,42

Inferior longitudinal fasciculus R

3,89

0,01

78,71

3,95

0,04

52,65

n.s.

n.s.

3,43

0,01

85,58

3,60

0,03

84,09

Superior longitudinal fasciculus (SLF) L

4,18

0,02

63,22

n.s.

3,53

0,05

0,19

n.s.

3,39

0,01

66,94

3,25

0,02

61,33

SLF (temporal part) L

1,82

0,02

100,00

n.s.

n.s.

n.s.

1,72

0,02

100,00

1,07

0,04

100,00

Superior longitudinal fasciculus (SLF) R

4,31

0,01

59,52

3,69

0,04

34,73

4,09

0,02

35,60

n.s.

4,50

0,01

69,41

3,82

0,02

55,17

SLF (temporal part) R

4,88

0,01

81,36

4,07

0,03

71,19

3,52

0,03

18,87

n.s.

4,64

0,01

82,46

4,36

0,02

80,00

Uncinate fasciculus L

2,67

0,02

52,00

n.s.

n.s.

n.s.

2,83

0,02

68,60

2,39

0,02

60,49

Uncinate fasciculus R

n.s.

n.s.

n.s.

n.s.

n.s.

n.s.

Fornix (cres) R

2,59

0,02

11,23

n.s.

n.s.

n.s.

2,08

0,03

14,02

2,07

0,03

29,17

Fornix (cres) L

4,55

0,01

53,71

3,91

0,03

30,75

4,09

0,01

31,81

n.s.

4,57

0,01

64,15

3,70

0,02

50,16

Anterior corona radiata R

3,36

0,02

38,36

n.s.

n.s.

n.s.

3,14

0,02

51,45

2,97

0,02

48,93

Anterior corona radiata L

3,58

0,01

74,94

3,24

0,04

29,71

3,52

0,02

47,64

3,55

0,04

15,65

3,70

0,02

54,34

3,51

0,03

51,81

Superior corona radiata R

3,73

0,02

78,01

3,83

0,04

18,51

3,35

0,04

10,49

n.s.

3,29

0,02

78,25

3,15

0,02

78,28

Superior corona radiata L

3,58

0,01

68,31

3,18

0,03

40,09

3,76

0,01

42,37

3,33

0,04

11,17

3,30

0,01

76,92

3,20

0,03

65,98

Posterior corona radiata R

3,42

0,01

43,82

n.s.

n.s.

n.s.

3,36

0,01

53,02

2,62

0,02

37,54

Posterior corona radiata L

3,87

0,01

64,26

3,60

0,03

36,48

3,65

0,02

54,46

n.s.

3,74

0,01

66,00

3,37

0,03

59,06

  1. Abbreviations: MD Mean diffusivity, AxD Axial diffusivity, RD Radial diffusivity
  2. Note: “Recessive contrast”: APOE-ε4 homozygotes > others; “additive contrast”: positive association with the number of carried APOE-ε4 alleles; dom. “dominant contrast”: APOE-ε4 carriers > APOE-ε4 noncarriers
  3. ROIs are taken using the intersection between the skeleton produced by TBSS and the John Hopkins University tract-based white matter atlas [65]. The table also reports the most significant t and p values (corrected using FWE-TFCE) and the relative size (as % of total tract size) of the significant clusters